مرکز تحقیقات ایمونولوژی بالینی انجام پژوهشهای بنیادی-کاربردی مورد نیاز جامعه علمی استان سیستان و بلوچستان در زمینههای ایمونولوژی نقایص ایمنی، سرطان،آسم و آلرژی، ایمونولوژی بارداری، و تولید فرآورده های ایمونولوژیک و آنتی بادی های مونوکلونال در جهت کمک به تشخیص و درمان بیماریهای قید شده و دستیابی به جایگاه برتر در حوزه آموزشی و پژوهشی در بین مراکز تحقیقاتی جنوب شرق کشور را یکی از مهمترین رسالت های خود میداند. همچنین این مرکز، می کوشد بتواند در راستای بهبود خدمات پژوهشی،فضای متناسب با ارائه فعالیت پژوهشگران را فراهم نماید.