مرکز تحقیقات ایمونولوژی بالینی با هدف تحقیق، توسعه در زمینه زمینههای ایمونولوژی نقایص ایمنی، سرطان، آسم و آلرژی، ایمونولوژی بارداری، و تولید فرآورده های ایمونولوژیک و آنتی بادی های مونوکلونال به منظور توسعه فناوریهای نوین و کاربردی تاسیس شده است. این مرکز از طریق ارتباط نزدیک و تعامل بین محققین رشتههای مختلف مانند (ایمونولوژی، هماتولوژی، بیوشیمی، انگل شناسی، ژنتیک، عفونی، زنان، روماتولوژی و آنکولوژی) و همینطور مراکز تحقیقاتی در کشور و سطح بین المللی تمام ظرفیت های خود را بکار میگیرد تا ارتقا سطح سلامت جامعه حاصل شود. ماموریت های تعریف شده برای این مرکز در قالب موارد ذیل برنامه ریزی شده است:
تحقیقات پایه و کاربردی در زمینه بیماریهای ایمونولوژیک، نقایص ایمنی، آسم و آلرژی
تحقیقات پایه و کاربردی در زمینه بیماریهای خونی و انکولوژی
تحقیقات پایه و کاربردی در زمینه بیماریهای عفونی
تحقیقات پایه و کاربردی در زمینه بیماریهای داخلی و روماتولوژی
تحقیقات پایه و کاربردی در زمینه بیماریهای زنان، بارداری و سقط مکرر
گسترش و تعامل همکاری بین مراکز تحقیقاتی در کشور و در سطح بین الملل
آموزش و توانمند سازی نیروی انسانی در زمینه ایمونولوژی